沉浸式消毒机用于一次性PET瓶的消毒。它采用螺旋结构的轨道概念，其功能与洗瓶机相似。消毒过程首先是瓶子在单轨上移动并直接输送到瓶托架，然后进入消毒池浸透，瓶内没有消毒的空气会被完全抽出。
沉浸式处理保证瓶子的里外表面都被完全浸于消毒液中。当瓶子从消毒池中取出后被送进沥干区域，此时用与瓶子里同等的压力将无菌空气（100级）吹入机箱，进一步确保处理过程在无菌环境下进行。因此，消毒池成了一种将无菌空气和非无菌空气环境分开的气锁。 接着，瓶子在无菌水浴中进行冲洗工序，以除去残留的消毒剂。值得注意的是，消毒机和灌装机可同步操作。至于瓶盖的清毒，可采用已取得专利的沉浸式消毒机进行，具体方法是通过完全浸透瓶盖表面，完全抽出原有空气、气锁功能以形成完全无菌加工空问。接着，用无菌水冲洗瓶盖，1再通过充满无菌空气的隧道将瓶盖转送到输送装置上。
净化室I在消毒机与灌装机和封盖机之间，与机器一体；净化室H与气锁系统相连，其范围从消毒机的输出口开始，至灌装机和封盖机，长约1.5米。这2个净化室均装有HEPA过滤器、吹风机、照明灯和净化室监测仪器。