液体灌装机容器一定要保持清洁，所使用的灌装容器必须经过严格检查和清洗，不能使灌装后的饮料被污染；最后保持灌装车间的干净整洁也非常有必要。因为在生产过程中，其中饮品生产加工商最忌讳由于灌装机本身质量问题导致生产线无法正常运行，因此在使用灌装机时要注意灭菌、确保洁净、低温灌装。
清洗方法：
1.保持液体灌装机管道洁净，一切管道尤其是与物料间接或直接接触的管道，都要保持洁净，每周要刷洗，每天要走水，每次要灭菌；确保灌装机干净，
2.对其物料槽要进行刷洗和灭菌，保证与物料接触的部分都不能有积垢和杂菌。
3.生产过程中要保证瓶装饮料的生物稳定性灭菌是最好的方法，一定要控制好灭菌的时间和温度，确保最终效果，
4.避免杀菌时间过长或温度过高，减少饮料氧化，当杀菌后要尽快冷却使温度不超过35℃以上。
5.低温灌装是对饮品灌装最低要求，一般情况下饮料在低温环境中不易产品泡沫，有利于灌装。
6.在灌装机每次工作前，要用0～1℃的水使灌装机槽与输送管道温度降低，当灌装温度超过4℃时应先降低温度后在进行灌装操作。
7.利用保温槽，恒温灌，使物料在灌装的规定时间内保持一定的恒温，以免造成灌装机因温度变化过大而工作不稳定。
8.另外，灌装设备最好与其它设备隔绝，灌装机的润滑部分与灌装物料部分应防止交叉污染，输送带的润滑要用专用的肥皂水或润滑油。